神社の特徴に鰐口があり、現在は実物大のレプリカが取り付けられています。本物は博物館で管理されています。

敷地内に、神奈川県の銘木100選に選定されたしだれ桜があります。このしだれ桜は、樹齢250年(推定)、四方均等に伸びており、高さ12m、周囲2.5mもの大きさがあります。県指定文化財の「熊野権現影向図」が所蔵されていましたが、現在は博物館で管理されています。

相模十三社に選出されている石楯尾神社の境内には、樹齢400年を誇る二本杉が枝葉よく伸びています。兄弟杉とも言われるこの杉は、郷土の景観の他、学術的にも重要な物として、神奈川県の天然記念物に指定されています。神社の前には山つつじが群生しており、見頃となる4月下旬から5月には多くの人が訪れます。